Ο Δήμος Καλαμαριάς αποτελείται διοικητικά από μία ενιαία Δημοτική Ενότητα, τη Δημοτική Ενότητα Καλαμαριάς. Ωστόσο, η περιοχή διαιρείται γεωγραφικά σε επιμέρους γνωστές συνοικίες, οι οποίες είναι οι εξής:
- Νέα Κρήνη
- Καραμπουρνάκι
- Αρετσού (ή Ρύσιον Αλιέων)
- Άγιος Ιωάννης (Άη-Γιάννης)
- Βυζάντιο
- Βότση
- Φοίνικας
- Κηφισιά
- Μίκρα